Una cosa no tiene nada que ver con la otra, Terminal Server es únicamente "algo" que te permite acceder de modo remoto al ordenador al que te conectas y lo otro, pués el .NET Framework.
Lo que podria ser es que capacidades graficas, de sonido y demás no las tuvieras, pero de funcionalidad no deberia de darte problemas (alguna cosa que he probado por terminal siempre me ha funcionado, p ej, codigo que tenemos en la universidad ejecutado desde casa).
2B||!2B that's the question